整個二結穀倉是由穀倉「主體建築」以及周邊陸續增建之糙米倉庫、肥料倉庫、11號庫等附屬建築所構成的「建築群」。「主體建築」由事務所、儲穀倉庫、碾米機房所構成，承載穀倉之主要與基本功能：磚造(牆厚約40 cm)木構（屋頂），建築投影面積約780平方公尺。

         為確保稻榖品質之基本功能，除考量防震安全而採磚造加混凝土承重牆之外，特別著重屋頂構造，開窗位置與型式，各種通風口設置，地板、壁體及下墊的結構，適當內部裝修…等，以達到避免太陽直射、維持低常溫、確保溼度等儲米環境調節功能。結構上，為達成足夠的穀倉容量，因而採用大跨距桁架屋頂，以及可承載更大壓力之承重牆。材料上，桁架則採傳統之木材，承重牆則採用紅磚。

         1935年利澤簡信用組合於五年前所設之二結第三事務所旁興建內設碾米場的農業倉庫，即為二結穀倉建築之後棟，此一倉庫為一相當專業之倉庫，具有自動化的機械運送設備，三層樓高的大型碾米機，以及良好的通風與防潮設計，同時在建築物東側租下一約兩百坪之土地，舖上當時相當昂貴的水泥，供農民曬穀之用，當時人稱之為組合埕。

         光復後，國民政府來台，接收了過去殖民時期米糧的控制機關「糧食統制倉庫」，之後一律撥藉各鄉鎮市區農會使用，建立公糧委託倉儲制度，二結穀倉亦為其中之一。於是原本做為農民合作機制的農業倉庫，轉變為替國家經收、保管、加工、撥付糧食的受託機構。其主要承辦業務包括「軍公教配糧及專案糧」、「田賦徵收實物」、「肥料換榖」等。

         然而，在五○、六○年代台灣在以農業扶植工業的時期，基礎農業的發展，已今非昔比，原本是相當進步擁有自動化設備的二結穀倉，也逐漸老舊，機械老化腐蝕而遭拆除，建築也因天災破壞而失去原貌及原有之空間機能，而於民國72年結束其運作。